在这场名为巫蛊的灾难中，卫子夫利用皇后的权力，让太子刘据用中厩车架，从军械库中取出武器，并可以调遣长乐宫卫队。虽然再怎么说太子是被逼反的，但是事实上确实也真的反了。在封建社会，任何皇帝都不允许谋反。顺带一提，谋反的帮手卫子夫肯定也是汉武帝容不下的。
汉武帝下令没收了卫子夫的皇后印，但并未下旨废除她的皇后之位。这是他们夫妻四十多年的最后一次交流。从此卫子夫被汉武帝彻底无视了，这也意味着她绝不可能善终。
其子刘据战败后自杀，其玺被收回。卫子夫之后的每一天，都会活在屈辱中，于是这个出身卑微，但是半辈子都极其尊贵的女人选择了从容自杀，结束了她跌宕起伏的一生。
卫子夫死后，史料中没有汉武帝处置她尸体的记载。前面说过，她完全被汉武帝忽视了，所以她的身后事办的极其草率。这个时候，一个熟悉的名字出现在史料中：苏文。他是汉武帝身边的黄门，曾经陷害过刘据，也是刘据军队要剿灭的主要对象之一。只是这货油嘴滑舌，见势不妙，开溜的早，躲过了太子的追捕。
万万没想到，就是这个苏文，和另一个黄门姚定汉处理了一代贤后卫子夫的尸体。他们把卫子夫的尸体“置之公车令空舍，盛以小棺，将卫皇后葬在长安城南桐柏亭”，没有皇后该有的盛大葬礼，也没有金碧辉煌的陪葬品，没有人来悼念，就这么早早了事了。
一直到十七年后，卫子夫的曾孙刘询当上了皇帝。他重新评价了“巫蛊之祸”，赐曾祖母卫子夫“追谥曰思后，置田邑三百家”，谥号“思后”，安排三百户为其守墓，重新享受到了皇后应该有的尊荣，她也成为了中国历史上第一个有谥号的皇后。
刘询给她谥号，其实也是让她和汉武帝彻底分开的意思，桥归桥，路归路，过往种种谁对谁错已经说不清，各自不再见，也不必合葬。
汉武帝，一代天子骄子，一辈子美女无数，死后金银财宝陪葬品也无数，但是没有一个人与他合葬，他生前对自己的亲人赶尽杀绝，死后也注定只是个孤家寡人。
